Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTBP49356 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTBP49356 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTBP49356 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FNTBP49356 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FNTBP49356 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FNTBP49356 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FNTBP49356 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FNTBP49356 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FNTBP49356 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FNTBP49356 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms