Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms