Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDKN1BP46527 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms