Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTR1BP42025 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms