Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms