Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5C1P36542 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms