Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 SPRR3-202ENST00000331860 985 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.26-201ENST00000547793 284 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC008770.1-204ENST00000489336 622 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC003075.1-206ENST00000448664 541 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC095050.1-201ENST00000502661 905 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD11P31277 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD11P31277 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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