Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms