Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABRB3P28472 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRB3P28472 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms