Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD10P28358 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms