Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD1P28340 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD1P28340 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD1P28340 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLD1P28340 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLD1P28340 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLD1P28340 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLD1P28340 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD1P28340 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD1P28340 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD1P28340 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD1P28340 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD1P28340 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms