Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNCP24821 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNCP24821 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNCP24821 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNCP24821 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNCP24821 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNCP24821 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNCP24821 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNCP24821 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNCP24821 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNCP24821 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNCP24821 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNCP24821 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNCP24821 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms