Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGS1P23219 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGS1P23219 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms