Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPRR1BP22528 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms