Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRHP20396 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRHP20396 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRHP20396 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRHP20396 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRHP20396 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRHP20396 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRHP20396 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRHP20396 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRHP20396 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRHP20396 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRHP20396 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRHP20396 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRHP20396 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRHP20396 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRHP20396 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRHP20396 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRHP20396 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TRHP20396 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRHP20396 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRHP20396 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRHP20396 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRHP20396 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRHP20396 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRHP20396 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRHP20396 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRHP20396 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRHP20396 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TRHP20396 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRHP20396 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRHP20396 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TRHP20396 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms