Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM21P19474 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms