Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms