Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF3P18847 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF3P18847 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATF3P18847 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF3P18847 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF3P18847 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF3P18847 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF3P18847 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms