Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCC1P18754 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms