Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB1P16220 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CREB1P16220 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CREB1P16220 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms