Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAV1P15498 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAV1P15498 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms