Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA1P14867 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA1P14867 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA1P14867 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA1P14867 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABRA1P14867 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GABRA1P14867 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms