Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF35P13682 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms