Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms