Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms