Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD1P0DJD0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms