Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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FAM200BP0CF97 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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FAM200BP0CF97 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM200BP0CF97 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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