Protein–RNA interactions for Protein: P09661

SNRPA1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA1P09661 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPA1P09661 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPA1P09661 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms