Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB7P09629 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms