Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGAP02671 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FGAP02671 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGAP02671 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGAP02671 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGAP02671 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGAP02671 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGAP02671 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGAP02671 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms