Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTA1P02549 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms