Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBX7O95931 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX7O95931 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX7O95931 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX7O95931 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CBX7O95931 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms