Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBXN7O94888 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBXN7O94888 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms