Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms