Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPSNAP2O75323 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms