Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNSO60931 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNSO60931 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNSO60931 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNSO60931 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms