Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPLO60437 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPLO60437 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPLO60437 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PPLO60437 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PPLO60437 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PPLO60437 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PPLO60437 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PPLO60437 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PPLO60437 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PPLO60437 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PPLO60437 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PPLO60437 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPLO60437 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PPLO60437 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPLO60437 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPLO60437 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPLO60437 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPLO60437 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPLO60437 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPLO60437 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPLO60437 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms