Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRC1O43663 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRC1O43663 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRC1O43663 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRC1O43663 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRC1O43663 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRC1O43663 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRC1O43663 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRC1O43663 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRC1O43663 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRC1O43663 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRC1O43663 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRC1O43663 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRC1O43663 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRC1O43663 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms