Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIPA1L1O43166 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1L1O43166 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms