Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGFO15240 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGFO15240 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGFO15240 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VGFO15240 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGFO15240 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGFO15240 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VGFO15240 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VGFO15240 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VGFO15240 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VGFO15240 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VGFO15240 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms