Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP23O00161 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms