Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E9PMD0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E9PMD0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E9PMD0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
E9PMD0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
E9PMD0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
E9PMD0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E9PMD0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PMD0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PMD0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PMD0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms