Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-2B6SEH9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms