Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DEV8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DEV8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DEV8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DEV8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DEV8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms