Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms