Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6L9A6NEM1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GOLGA6L9A6NEM1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms