Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms