Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 STARD4-212ENST00000512160 3500 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GALNTL6-204ENST00000508122 1755 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NAGA-202ENST00000402937 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RIMS2-202ENST00000339750 3780 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 INPP5B-206ENST00000458109 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 C1orf147-201ENST00000367119 2096 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZC4H2-202ENST00000374839 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LILRB3-202ENST00000346401 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 POM121B-201ENST00000380760 2487 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF16-209ENST00000611477 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CDC42EP3-206ENST00000611976 5124 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MTA2-202ENST00000524902 2577 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02210-CRHR1-202ENST00000634540 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF7-203ENST00000395023 2815 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZBTB14-208ENST00000615385 3350 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MYT1L-203ENST00000407844 3642 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC22A8-201ENST00000311438 1716 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PLA2G4C-201ENST00000354276 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC25A44-201ENST00000359511 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RN7SKP180-201ENST00000363913 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL354984.1-201ENST00000371169 1854 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.4 ms