Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms