Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRC38Q5VT99 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRC38Q5VT99 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRC38Q5VT99 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRC38Q5VT99 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRC38Q5VT99 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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LRRC38Q5VT99 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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LRRC38Q5VT99 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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LRRC38Q5VT99 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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LRRC38Q5VT99 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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LRRC38Q5VT99 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRC38Q5VT99 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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